生命科學(xué)與工程學(xué)院李英研究員在《Gut Microbes》發(fā)表最新研究成果
2020年6月25日，《Gut Microbes》（中科院一區(qū),，IF=7.4）在線發(fā)表了題為“ Life-long
dynamics of the swine gut microbiome and their implications in probiotics
development and food safety ” 的論文,。 生命科學(xué)與工程學(xué)院李英研究員為本論文的第一作者，佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院為第一單位，華南農(nóng)業(yè)大學(xué)王修啟教授為合作作者,，中國農(nóng)業(yè)大學(xué)王軍軍教授和美國阿肯色大學(xué)知名學(xué)者為通訊作者,。
腸道菌群在豬營養(yǎng)、健康和疾病等方面起著重要作用,，通過調(diào)控腸道菌群促進(jìn)豬健康是實現(xiàn)低抗養(yǎng)殖的一個重要途徑,。
在前期合作研究中，團(tuán)隊以17頭仔豬為實驗對象,，收集了胎便,、哺乳期、保育期,、生長期,、育肥期四個階段的糞便樣品，利用基于16S rDNA深度測序和分析方法,，發(fā)現(xiàn)豬不同生長階段腸道菌群組成和結(jié)構(gòu)顯著不同（見圖一）,。其中，差別最大的是哺乳期,。進(jìn)一步,，用置換多變量方差分析（PERMANOVA）研究了年齡、體重,、飲食,、性別、個體豬和母豬等因素對豬腸道菌群的影響,。發(fā)現(xiàn)飲食,、年齡和體重都是塑造豬腸道微生物組的重要因素，其中飲食是最重要的影響因素,，解釋了約35％的變異,。
為了確定生長性能相關(guān)的細(xì)菌類群，探索潛在的益生菌,。用隨機(jī)森林模型,，以500個細(xì)菌單元分類作為特征，體重作為結(jié)果,，進(jìn)行回歸分析,，預(yù)測得到每個階段生長性能相關(guān)的前50種細(xì)菌特征。發(fā)現(xiàn)每一個生長階段跟生長相關(guān)的菌屬是不一樣的,，而且這些生長相關(guān)的菌屬既包含常駐菌也包含過路菌,，我們的結(jié)果提示不同的生長階段能促進(jìn)生長的菌也是不一樣的（Wang et al.2019，Microbiome）,。在此基礎(chǔ)上,，本研究鑒定了不同生長階段豬腸道菌群核心菌群,，并提出使用混合的、針對不同生長階段的組合益生菌,，以最大程度促進(jìn)豬健康生長的觀點(diǎn),。此外，豬肉作為全世界消費(fèi)最多的肉類,，也是食源性致病菌的主要來源,，大部分關(guān)于豬肉食品安全的研究集中在豬屠宰之后，然而本研究發(fā)現(xiàn),，有些致病菌例如圖二的彎曲桿菌屬(Campylobacter)和大腸桿菌屬的一些菌從豬出生就存在,，其相對豐度隨生長而發(fā)生變化（圖二）,，這一結(jié)果提示豬出欄前的生長時期可作為食品安全干預(yù)的新窗口,。（Li et al. 2020 Gut Microbes，)
