6月25日,，《Gut Microbes》（中科院一區(qū)，IF=7.4）在線發(fā)表了題為“Life-long dynamics of the swine gut microbiome and their implications in probiotics development and food safety” 的論文。我校生命科學(xué)與工程學(xué)院李英研究員為本論文的第一作者,，佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院為第一單位，華南農(nóng)業(yè)大學(xué)王修啟教授為合作作者,，中國農(nóng)業(yè)大學(xué)王軍軍教授和美國阿肯色大學(xué)知名學(xué)者為通訊作者,。
圖一 不同生長階段豬腸道菌群結(jié)構(gòu)的縱向變化
為了確定生長性能相關(guān)的細(xì)菌類群，探索潛在的益生菌。用隨機(jī)森林模型,，以500個(gè)細(xì)菌單元分類作為特征,，體重作為結(jié)果，進(jìn)行回歸分析,，預(yù)測得到每個(gè)階段生長性能相關(guān)的前50種細(xì)菌特征,。發(fā)現(xiàn)每一個(gè)生長階段跟生長相關(guān)的菌屬是不一樣的，而且這些生長相關(guān)的菌屬既包含常駐菌也包含過路菌,，我們的結(jié)果提示不同的生長階段能促進(jìn)生長的菌也是不一樣的（Wang et al.2019,，Microbiome）。在此基礎(chǔ)上,，本研究鑒定了不同生長階段豬腸道菌群核心菌群,，并提出使用混合的、針對不同生長階段的組合益生菌,，以最大程度促進(jìn)豬健康生長的觀點(diǎn),。此外，豬肉作為全世界消費(fèi)最多的肉類,，也是食源性致病菌的主要來源,，大部分關(guān)于豬肉食品安全的研究集中在豬屠宰之后，然而本研究發(fā)現(xiàn),，有些致病菌例如圖二的彎曲桿菌屬(Campylobacter)和大腸桿菌屬的一些菌從豬出生就存在,，其相對豐度隨生長而發(fā)生變化（圖二）,，這一結(jié)果提示豬出欄前的生長時(shí)期可作為食品安全干預(yù)的新窗口,。（Li et al. 2020 Gut Microbes，)
圖二：豬不同生長時(shí)間點(diǎn)糞便中病原微生物相對含量的動(dòng)態(tài)變化
（生命科學(xué)與工程學(xué)院）