李英（碩士生導(dǎo)師）
性別：女
職稱：佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院 研究員
職務(wù)：佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院 生命科學(xué)與工程學(xué)院 副院長
個人榮譽：2006年入選中科院“西部之光”人才項目；
2009年獲第十一屆“李汝其”動物遺傳學(xué)獎,；
2012獲四川省“千人計劃”特聘專家稱號,；
2013年入選四川省科學(xué)技術(shù)帶頭人后備人才；
2017年獲四川省青年科技獎,；
2017獲得四川省有突出貢獻的中青年專家稱號,；
2019年獲得第三屆四川省“十大海創(chuàng)科教人物”稱號。
教育與工作簡歷：1998年畢業(yè)于云南大學(xué),，獲學(xué)士學(xué)位,；
2005年畢業(yè)于中科院昆明動物研究所，師從張亞平院士,，獲理學(xué)博士學(xué)位,；
2005年至2011年作為助理研究員、副研究員在中科院昆明動物研究所工作,；
2009年至2012年在美國密西根大學(xué)從事訪問學(xué)者/博士后研究,，導(dǎo)師：張建之；
2012年4月至2019年11月 四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 研究員
2019年12月至今 佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院 研究員
主要研究內(nèi)容和研究成果
綜合利用基因組學(xué),、轉(zhuǎn)錄組學(xué),、宏基因組學(xué)等方法，從動物自身遺傳信息及其共生菌群角度研究動物健康及其環(huán)境適應(yīng)性等問題,。近年來,，在Nature Genetics，Current Biology等期刊發(fā)表SCI論文100余篇,，其中以第一或通訊作者發(fā)表SCI論文51篇,。
教學(xué)與人才培養(yǎng)：
承擔(dān)本科生《動物遺傳學(xué)》,、碩士生《科技論文寫作》和《生物信息學(xué)》等課程。已經(jīng)培養(yǎng)出站博士后1名,，畢業(yè)博士研究生7人,，碩士研究生16人。其中1名博士研究生獲省級優(yōu)秀研究生,，4名碩士獲得校級優(yōu)秀畢業(yè)生,，3人獲得研究生國家獎學(xué)金，5人獲得國家留學(xué)基金委資助到國外讀博士,、聯(lián)培博士或者博士后,， 6人獲得校級優(yōu)秀研究生。
社會兼職：
擔(dān)任中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物微生態(tài)分會常務(wù)理事,、中國動物學(xué)會進化理論專委會常務(wù)委員,、廣東省豬遺傳資源委員會委員,、Frontiers in Microbiology Associate Editor,。
主持項目：
1. 國家重點研發(fā)計劃，政府間國際合作項目子課題,，早期斷奶應(yīng)激影響仔豬腸道干細胞和菌群發(fā)育及其互作的分子機制,，2023.12-2026.12, 子課題負責(zé)人，60萬
2. 廣東省教育廳重點學(xué)科科研能力提升項目 腸道菌群與宿主互作影響豬生長的機制 2022.12-2025.12 100萬,，主持,，在研
3. 國家自然科學(xué)基金面上項目 基于皮膚菌群研究高原哺乳動物適應(yīng)紫外環(huán)境的分子進化機制（32170430） 2022.01-2024.12 58萬，主持,，在研
4. 國家重點研發(fā)計劃課題二子課題 針對西北煤化工場地的腐殖質(zhì)類修復(fù)材料與技術(shù)研發(fā) 2022.01-2025.12 28萬,，在研
5. 橫向項目 貓腸道菌群與益生菌開發(fā) 2021.09-2024.12 93.15萬，主持,，在研
6. 廣東省教育廳廣東省研究生學(xué)術(shù)論壇 新農(nóng)科背景下畜牧獸醫(yī)研究生創(chuàng)新論壇 2021.09-2022.08 5萬,，主持，在研
7. 韓國高麗大學(xué)委托橫向經(jīng)費,、從細胞水平,、臨床前和人群干預(yù)研究姜黃素對空氣污染導(dǎo)致的肺部損傷的作用、2020.1-2021.12,、30萬,、在研、主持
8. l 國家自然科學(xué)基金面上項目,、31471997,、藏豬腸道菌群及其與高原低氧環(huán)境適應(yīng)性的研究、2015/1-2018/12,、86萬,、已結(jié)題,、主持
9. l 四川省杰出青年基金項目、2013JQ0014,、哺乳動物腸道微生物菌群與食性及其宿主系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的研究,、2013/1 -2015/12、50萬,、已結(jié)題,，主持
10. l 四川省“百人計劃”青年項目，2012年,、50萬,，已結(jié)題，主持
11. 中科院昆明動物研究所國家重點實驗室開放課題 2014-2016 ,，9萬,，已結(jié)題，主持
12. l 動物分子遺傳與進化創(chuàng)新團隊,，四川省教育廳青年創(chuàng)新團隊項目,，2014 /1-2016/12，40萬,，在研,，團隊負責(zé)人
13. l 國家自然科學(xué)基金青年基金，30600066（生殖免疫相關(guān)基因的分子進化研究,，項目號）,，2007/1-2009/12、22萬,、已結(jié)題,、主持
14. l 云南省自然科學(xué)基金、 2006C0054M,、防御素基因家族分子進化及其功能演化的研究,、2007/1-2009/12、5萬,、已結(jié)題,、主持
15. l 中國科學(xué)院昆明動物所青年人才基金（生殖過程中生物對于微生物感染防御的適應(yīng)性機制），2007/9-2009/12,，9萬
16. l 中國科學(xué)院 “西部之光”項目,、0602311081、細胞因子超家族的分子進化研究,、2006/7-2009/7,、20萬、已結(jié)題、主持
發(fā)表論文（第一或通訊作者）：
1) Yang, J.; Fan, Y.; Jin, R.; Peng, Y.; Chai, J.; Wei, X.; Zhao, Y.; Deng, F.; Zhao, J.; Li, Y. Exploring the Intestinal Microbial Community of Lantang Pigs through MetagenomeAssembled Genomes and Carbohydrate Degradation Genes. Fermentation 2024, 10, 207. fermentation10040207
2) Feilong Deng?, Yanhua Han?, Yushan Huang?, Desheng Li?, Jianmin Chai, Linhua Deng, Ming Wei, Kai Wu, HuaBin Zhao, Guan Yang, Jiangchao Zhao*, Ying Li*, Chengdong Wang*. 2024. A comprehensive analysis of antibiotic resistance genes in the giant panda gut. iMeta e171.
3) Jianbo Yang, Routing Chen, Yunjuan Peng, Jianmin Chai, Ying Li and Feilong Deng (2023) The role of gut archaea in the pig gut microbiome: a mini-review. Front. Microbiol. 14:1284603. doi: 10.3389/fmicb.2023.1284603.
4) Zhihao Zhang, Haixia Ran, Yutong Hua, Feilong Deng, Bo Zeng, Jianmin Chai and Ying Li (2023) Screening and evaluation of skin potential probiotic from high-altitude Tibetans to repair ultraviolet radiation damage. Front. Microbiol. 14:1273902. doi: 10.3389/fmicb.2023.1273902
5) Zhang Zhihao , Chengqian Zhang , Yikai Zhong , Shuli Yang , Feilong Deng , Ying Li, JIANMIN CHAI1* The spatial dissimilarities and connections of the microbiota in the upper and lower respiratory of beef cattle. 2023 Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (in press).
6) Feilong Deng, Chengdong Wang, Desheng Li, Yunjuan Peng, Linhua Deng , Yunxiang Zhao Zhihao Zhang, Ming Wei , Kai Wu , Jiangchao Zhao and Ying Li. The unique gut microbiome of giant pandas involved in protein metabolism contributes to the host’s dietary adaption to bamboo. Microbiome 11, 180 (2023).
7) Wei L, Zeng B, Zhang S, Guo W, Li F, Zhao J and Li Y (2023) Hybridization altered the gut microbiota of pigs. Front. Microbiol. 14:1177947. doi: 10.3389/fmicb.2023.1177947
8) Guo W#*, Ren K#, Ning R#, Li C#, Zhang Y, Gan Y, Fu X, Xiao C, Pang Y, Cheng L, Zhang S, Li D, Zhao J, Dai M*, and Li Y* (2023) Microbial species from multiple maternal body sites shape the developing giant panda (Ailuropoda melanoleuca) cub gut microbiome. Molecular Ecology. doi: 10.1111/mec.16869.
9) Zhang S, Ning R, Zeng B, Deng F, Kong F, Guo W, Zhao J and Li Y (2022) Gut Microbiota Composition and Metabolic Potential of Long-Living People in China. Front. Aging Neurosci. 14:820108. doi: 10.3389/fnagi.2022.820108.（SCI, IF=5.701）
10) Deng Feilong, Peng Yunjuan, Zhang Zhihao, Samantha Howe, Wu Zhuosui, Dou Jieying, Li Yuling, Wei Xiaoyuan, Wang Xiaofan, Liang Yong, Zhao Jiangchao*, and Ying Li*. Weaning time affects the archaeal community structure and functional potential in pigs. Frontiers in Microbiology 2022, 13:845621.
11) Peng Yunjuan, Xie Ting, Wu Zhuosui, Zheng Wenxiao, Zhang Tao, Samantha Howe, Chai J, Deng Feilong*, Li Ying*, and Zhao Jiangchao*: Archaea: An under-estimated kingdom in livestock animals. Front. Vet. Sci. 2022, 9:973508.
12) Deng, Feilong, Yushan Li, Yunjuan Peng, Xiaoyuan Wei, Xiaofan Wang, Samantha Howe, Hua Yang, Yingping Xiao, Hua Li, Jiangchao Zhao, and Ying Li. 2021. “The Diversity, Composition, and Metabolic Pathways of Archaea in Pigs” Animals 11, no. 7: 2139. ani11072139
13) Siyuan Zhang, Bo Zeng, Yinfeng Chen, Mingyao Yang, Fanli Kong, Limin Wei, Feng Li, Jiangchao Zhao and Ying Li. “Gut microbiota in healthy and unhealthy long-living people.” 779 Gene, (2021): 145510. (SCI, IF=2.984)
14) Limin Wei#, Bo Zeng#, Siyuan Zhang, Feng Li, Fanli Kong, Haixia Ran, Hong-Jiang Wei, Jiangchao Zhao, Mingzhou Li*,，Ying Li*. Inbreeding Alters the Gut Microbiota of the Banna Minipig. Animals (Basel). 2020 Nov 16;10(11):2125. doi: 10.3390/ani10112125. PMID: 33207622; PMCID: PMC7697339.
15) Chengdong Wang#, Feng Li#, Linhua Deng, Mingzhou Li, Ming Wei, Bo Zeng, Kai Wu, Zhongxian Xu, Rongping Wei, Limin Wei, Weiping Liu, Siyuan Zhang, Lin Xu, Yan Huang, Desheng Li, Ying Li*, Hemin Zhang*. Identification and characterization of miRNA expression profiles across five tissues in giant panda. Gene. 2020 Oct 12:145206. doi: 10.1016/j.gene.2020.145206.
16) Feng Li#, Chengdong Wang#, Zhongxian Xu#, Mingzhou Li, Linhua Deng, Ming Wei, Hemin Zhang, Kai Wu, Ruihong Ning, Diyan Li, Mingyao Yang, Mingwang Zhang, Qingyong Ni, Bo Zeng*, Desheng Li*, Ying Li*. Transcriptome Profiling across Five Tissues of Giant Panda. BioMed Research International. 2020 Aug 10; 2020:3852586. doi: 10.1155/2020/3852586. PMID: 32851066; PMCID: PMC7436357.
17) Ying Li, Xiaofan Wang , Xiu-qi Wang , Junjun Wang* & Jiangchao Zhao* Life-long dynamics of the swine gut microbiome and their implications in probiotics development and food safety. Gut Microbes, DOI: 10.1080/19490976.2020.1773748.（IF=9.34,，一區(qū)，第一作者）
18) Yinfeng Chen, Siyuan Zhang, Bo Zeng, Jiangchao Zhao, Mingyao Yang, Mingwang Zhang, Yan Li, Qingyong Ni, De Wu, Ying Li* Transplant of microbiota from long-living people to mice reduces aging-related indices and transfers beneficial bacteria. Aging-US 2020 12(6) 4778-4793.
19) Wei Guo#, Yinfeng Chen#, Chengdong Wang, Ruihong Ning, Bo Zeng, Jingsi Tang, Caiwu Li,Mingwang Zhang, Yan Li, Qingyong Ni, Xueqin Ni, Hemin Zhang, Desheng li, Jiangchao Zhao, Ying Li*. The carnivorous digestive system and bamboo diet of giant pandas may shape their low gut bacterial diversity. Conservation Physiology 2020, 8, coz104,
20) Bo Zeng#, Siyuan Zhang #, Huailiang Xu, Fanli Kong, Xianqiong Yu, Ping Wang, Mingyao Yang, Diyan Li, Mingwang Zhang, Qingyong Ni, Yan Li, Xiaolan Fan, Deying Yang, Ruihong Ning ,Jiangchao Zhao, Ying Li* Gut microbiota of Tibetans and Tibetan pigs varies between high and low altitude environments. Microbiological Research 2020, 235, 126447.
21) Tang,，Jingsi#; Wang, Chengdong#; Zhang, Hemin#; Zhao, Jiangchao#; Guo, Wei; Sudhanshu Mishra; Kong, Fanli; Zeng, Bo; Ning, Ruihong; Li, Desheng; Yang, Jiandong; Yang, Mingyao; Zhang, Mingwang; Ni, Qingyong; Li, Yan; Li, Ying* Gut microbiota in reintroduction of giant panda. Ecology and Evolution, 2020, 10: 1012-1028.
22) Guo, Wei; Mishra, Sudhanshu; Wang, Chengdong; Zhang, Hemin; Ning, Ruihong; Kong, Fanli; Zeng, Bo; Zhao, Jiangchao*; Li, Ying* Comparative Study of Gut Microbiota in Wild and Captive Giant Pandas (Ailuropoda melanoleuca) Genes, 2019, 10(10): 0-827.
23) Xiaofan Wang#, Tsungcheng Tsai#, Feilong Deng, Xiaoyuan Wei, Jianmin Chai, Joshua Knapp, Jason Apple,Charles V. Maxwell, Jung Ae Lee, Ying Li*, Jiangchao Zhao* Longitudinal investigation of the swine gut microbiome from birth to market reveals stage and growth performance associated bacteria. Microbiome. 2019;7(1):109. Epub 2019/08/01. doi: 10.1186/s40168-019-0721-7. PubMed PMID: 31362781; PubMed Central PMCID: PMCPMC6664762. （SCI,，IF=16.8通訊作者）（入選高被引論文）
24) Hao Guan#, Yanhong Yan#, Xiaoling Li, Xiaomei Li, Yang Shuai, Guangyan Feng，Qifan Ran, Yimin Cai, Ying Li*, Xinquan Zhang*. Microbial communities and natural fermentation of corn silages prepared with farm bunker-silo in Southwest China. Bioresour Technol. 2018;265:282-90. Epub 2018/06/17. doi: 10.1016/j.biortech.2018.06.018. PubMed PMID: 29908496. （SCI,，IF=5.81 通訊作者）
25) Guo Wei（#）, Mishra Sudhanshu（#）, Zhao Jiangchao（#）, Tang Jingsi, Zeng Bo, Fanli Kong, Ning Ruihong, Li Miao, Zhang Hengzhi, Zeng Yutian, Tian Yuanliangzi, Zhong Yihang, Luo Hongdi, Liu Yunhan, Yang Jiandong, Yang Ming, Zhang Mingwang, Li Yan, Ni Qing-Yong, Li Ying（*）. Metagenomic Study Suggests That the Gut Microbiota of the Giant Panda (Ailuropoda melanoleuca) May Not Be Specialized for Fiber Fermentation. Frontiers in Microbiology, 2018. 9. 10.3389/fmicb.2018.00229
26) Bo Zeng（#）, Jiangchao Zhao（#）, Wei Guo（#）, Siyuan Zhang, Yutong Hua, Jingsi Tang, Fanli Kong, Xuewu Yang, Lizhi Fu, Kun Liao, Xianqiong Yu, Guohong Chen, Long Jin1, Surong Shuai, Jiandong Yang, Xiaohui Si, Ruihong Ning, Sudhanshu Mishra and Ying Li（*）, High-Altitude Living Shapes the Skin Microbiome in Humans and Pigs, Frontiers in Microbiology, 2017, 8:1929 （SCI,，IF=4.076 通訊作者）
27) Fanli Kong, Yutong Hua, Bo Zeng, Ruihong Ning, Ying Li（*）, Jiangchao Zhao（*）. Gut microbiota signatures of longevity. Current Biology ,2016 26 R832-3.（SCI，IF=8.983 通訊作者）
28) Jingsi Tang, Ruihong Ning, Bo Zeng, Ying Li*. Molecular Evolution of PTEN Pseudogenes in Mammals. 2016, PLoS ONE 11 (12): e0167851. doi:10.1371（SCI,，IF=3.057, 通訊作者）
29) {Wang, 2016 #1}Lizhi Wang,Qin Xu, Fanli Kong,Yindong Yang,Wu De, Sudhanshu Mishra, Ying Li（*）. Exploring the Goat Rumen Microbiome from Seven Days to Two Years, Plos One,2016,e0154354（SCI,，IF=3.057, 通訊作者）（引用35次）
30) Bo Zeng, ShuShu Han, Ping Wang, Bin Wen, Wensu Jian,Wei Guo, Zhiju Yu ,Dan Du, Xiangchao Fu, Fanli Kong, Mingyao Yang, Xiaohui Si,Jiangchao Zhao and Ying Li（*）, The bacterial communities associated with fecal types and body weight of rex rabbits, Scientific Reports 2015 Mar 20;5:9342. doi: 10.1038/srep09342.（SCI，IF=5.228,，通訊作者）（引用61次）
31) Ying Li（#）（*）, Wei Guo, Shushu Han,，Fanli Kong, Chengdong Wang,Desheng Li, Heming Zhang, Mingyao Yang, Huailiang Xu，Bo Zeng ,，Jiangchao Zhao,The evolution of the gut microbiota in the giant and the red Pandas.Scientific Reports,，2015，DOi: 10.1038/srep10185（SCI,，IF=5.228,，第一和通訊作者）（引用24次）
32) Jingsi Tang,，Fanli Kong, Bo Zeng, Huailiang Xu , Mingyao Yang, Ying Li（*）,The primary structure of COMT gene is not involved in the diet shift of the giant or the red pandas, Gene,，2015, 562(2):244-6.（SCI，IF=2.319,，通訊作者）（引用1次）
33) Tang JS, Yang MY, Li Y, (2015) The functional roles of pseudogene in cancers. Hereditas (遺傳) 37(1): 8-16.（核心期刊,，通訊作者）
34) Ye Jiang（#）, Mingxian Yang（#）, Fuyao Han , Yan Li , Qingyong Ni, Yongfang Yao, Huailiang Xu, Ying Li（*）,and Mingwang Zhang（*）.The complete mitochondrial genome sequence of Red knobby newt Tylototriton shanjing (Amphibia: Caudata). Mitochondrial Dna the Journal of Dna Mapping Sequencing & Analysis,2015:1-2.（SCI，IF=1.701,共同通訊作者）
35) Ye Jiang（#）, Ziyuan Li（#）, Jiabin Liu, Yan Li , Qingyong Ni, Yongfang Yao , Huailiang Xu, Ying Li（*）,and Mingwang Zhang（*）.The complete mitochondrial genome sequence of Tylototriton taliangensis (Amphibia: Caudata). Mitochondrial Dna,2015:1-2.
36) 湯靜思,楊明耀,李英.假基因的功能及其在癌癥疾病中的重要作用[J].遺傳,2015,37(01):8-16.
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39) Lingjin Xian（#）, Ying Li（#）, Zhi Jiang, Jideng Ma, Long Jin, Lei Chen, Chaowei Zhou, Jie Zhang, Yingkai Liu, Li Zhu, An-an Jiang, Guoqing Tang, Jian Xiao, Jinyong Wang, Bo Zeng, Mingzhou Li, Xuewei Li（*）,Alterations in cecal microbiota of Jinhua piglets fostered by a Yorkshire sow, Chinese Science Bulletin, 2014,59(32): 4304-4311.
40) Mingzhou Li, Shilin Tian, Long Jin, Guangyu Zhou, Ying Li（#）, Yuan Zhang, Tao Wang, Carol K L Yeung, Lei Chen, Jideng Ma, Jinbo Zhang, Anan Jiang, Ji Li, Chaowei Zhou, Jie Zhang, Yingkai Liu, Xiaoqing Sun, Hongwei Zhao, Zexiong Niu, Pinger Lou, Lingjin Xian, Xiaoyong Shen, Shaoqing Liu, Shunhua Zhang, Mingwang Zhang, Li Zhu, Surong Shuai, Lin Bai, Guoqing Tang, Haifeng Liu, Yanzhi Jiang, Miaomiao Mai, Jian Xiao, Xun Wang, Qi Zhou, Zhiquan Wang, Paul Stothard, Ming Xue, Xiaolian Gao, Zonggang Luo, Yiren Gu, Hongmei Zhu, Xiaoxiang Hu, Yaofeng Zhao, Graham S Plastow, Jinyong Wang, Zhi Jiang, Kui Li, Ning Li, Xuewei Li（*） & Ruiqiang Li（*）,Genomic analyses identify distinct patterns of selection in domesticated pigs and Tibetan wild boars,Nature Genetics ,2013,45:1431–1438.9.（SCI,，IF=31.616，共同第一作者）（引用234次）
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(#)表示第一作者,，（*）表示通訊作者
授權(quán)專利
發(fā)明專利 202310133921.4,，一種非解乳糖鏈球菌及其應(yīng)用，第一發(fā)明人,，第一單位
發(fā)明專利 ZL 2023 1 03216825,，一種預(yù)測豬平均日增重的方法，20240130,，第二發(fā)明人,，第一單位
發(fā)明專利ZL 2023 1 0321599.8，一種預(yù)測豬飼料轉(zhuǎn)化率的方法20240419,，第一發(fā)明人,，第一單位
團體標(biāo)準(zhǔn) 題目：冷鮮豬肉電商銷售和配送技術(shù)規(guī)范 完成人：肖英平、任大喜,、呂文濤,、李英、汪雯,、洪奇華,、王珍、馬靈燕、胡子毅,、沈建平,、陳有亮、劉晨星,、王小驪,、付美貞、黃淑女,、余壽忠,、楊華、唐標(biāo),。發(fā)布單位：浙江省農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全學(xué)會
軟件著作權(quán)三項：Bactscore菌群培養(yǎng)性評分軟件,；貓繁育輔助管理軟件v1.0； 貓系譜管理軟件V1.0.
獲獎：中國商業(yè)聯(lián)合會科學(xué)技術(shù)全國商業(yè)科技進步獎 一等獎 2021,，7/15,。
指導(dǎo)本科生獲獎：獲得全國生命科學(xué)競賽二等獎兩項，三等獎一項,。
聯(lián)系方式：郵箱：[email protected]
